1. Kualiti udara: Oleh kerana ruang hotel kapsul yang kecil, pengudaraan tidak mudah, yang boleh menyebabkan penurunan kualiti udara dengan mudah, yang meningkatkan keselamatan nyawa dan risiko kesihatan penumpang.
2. Isu privasi: Memandangkan hotel kapsul adalah untuk setiap orang, isu keselamatan dan privasi mungkin berlaku.
3. Kemudahan dan peralatan: Penggunaan hotel kapsul adalah sangat kecil, dan untuk mengurangkan ruang, beberapa kemudahan dan peralatan terlalu dipermudahkan, yang mungkin tidak memenuhi keperluan pengembara.